Қарашай жылқысы — орташа өлшемді, жинақы, мықты, тауға бейімделген тұқым, шаршы немесе сәл созылған форматымен (индекс 98–102). Шоқтық биіктігі: биелерде 1480–1560 мм, айғырларда 1520–1600 мм. Тірі салмағы: биелерде 400–480 кг, айғырларда 450–530 кг. Дене қиғаш ұзындығы 1480–1580 мм, кеуде айналымы 1800–1950 мм. Шығыс типті құрғақ, жеңіл басымен ерекшеленеді — жалпақ маңдайы және сәл дөңес («қошқар» немесе «бүркіт») профилі, орташа ұзындықтағы бұлшықетті мойнымен, айғырларда желкесі және жалымен, қысқа мықты арқасымен, жалпақ бұлшықетті құйымшағымен, құрғақ мықты аяқтарымен және мықты қара тұяқтарымен. Қысқы жүні өте қалың және ұзын (40–50 мм-ге дейін), жазғы жүні қысқа, тегіс, жылтыр. Басым түстері: қара (басым), қара-қоңыр, қоңыр, қара-қоңыр, сұр (алма тәрізді). Шағын ақ белгілерге рұқсат етіледі; ала және шұбар түстер дисквалификацияланады. Негізгі үй жылқысынан ықшам дене бітімімен, кіші өсуімен, тұяқтары мен сіңірлерінің ерекше мықтылығымен, қалың қысқы жамылғысымен және биік тауға бейімделуімен ерекшеленеді.